Ген альфа-1 цепи коллагена 1-го типа (COL1A1)- полиморфизм с.104 - 441G>T (COLLAGEN, TYPE I, ALPHA-1 gene)

Полиморфизм	с.104 - 441G>T
Аминокислотное обозначение	—
Традиционное название	IVS1 2046 G>T
NCBI SNP	rs1800012

Исследование полиморфизма с.104 - 441G>T гена коллагена (COL1A1) имеет прогностическое значение, позволяющее определить риск развития остеопороза.

ГЕН ВХОДИТ В СОСТАВ ИССЛЕДОВАНИЙ:

VIP-Профили

• 101 ГПМ Полное генетическое обследование для мужчин
• 101 ГПЖ Полное генетическое обследование для женщин
• 102 ГПМ Полное генетическое обследование супружеской пары (мужчина)
• 102 ГПЖ Полное генетическое обследование супружеской пары (женщина)
• 103 ГПМ Полное генетическое обследование ребёнка (мальчик)
• 103 ГПЖ Полное генетическое обследование ребёнка (девочка)
  

Риск развития многофакторных заболеваний

Нарушения обмена веществ

• 115 ГП Остеопороз

Ген COL1A1 кодирует аминокислотную последовательность альфа-1 цепь белка коллагена 1 типа. Коллаген представляет собой белковую основу соединительных тканей, в том числе костной. Молекулы коллагена состоят из трёх полипептидных цепей, закрученных в спирали. Для первичной структуры молекул коллагена характерна частая повторяемость последовательности глицил-пролил-оксипролил. Благодаря коллагену костная ткань сочетает твердость и прочность с гибкостью и эластичностью.

Полиморфизм с.104 - 441G>T гена COL1A1 представляет собой точечную замену нуклеотида гуанина на тимин, что приводит к нарушению сайта связывания для фактора транскрипции гена COL1A1 в области первого интрона. У носителей варианта Т данного полиморфизма наблюдается нарушение нормального соотношения субъединиц в молекуле коллагена, что приводит к ухудшению его механических свойств. Вследствие этого носители варианта Т, особенно женщины в постменопаузе, гомозиготные по данному варианту, подвержены остеопорозу, костным переломам.

Таблица. Данные о связи вариантов полиморфизма с.104 - 441G>T гена COL1A1 с риском костных переломов.

Увеличение риска заболевания носителей T (T/T), по сравнению с людьми, гомозиготными по аллелю G (G/G).

Заболевания	Степень увеличения риска
Подверженность переломам костей	в 2 раза

• Материал для исследования: цельная кровь (2 - 3 мл), взятая с ЭДТА.
• Метод определения: ПЦР и рестрикционный анализ.

Литература:

1. Mann V., Ralston S.H. Meta-analysis of COL1A1 Sp1 polymorphism in relation to bone mineral density and osteoporotic fracture // Bone.- 2003.- V. 32, N 6.- P. 711-717.
2. Grant S.F., Reid D.M., Blake G. e.a. Reduced bone density and osteoporosis associated with a polymorphic Sp1 binding site in the collagen type I alpha 1 gene // Nat Genet.- 1996.- V. 14, N 2.- P. База OMIM *120150 www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/dispomim.cgi?id=120150

Смотрите также:

• Что такое молекулярно-генетические исследования?
• Задача молекулярно-генетических исследований.
• Как проводятся молекулярно-генетические исследования?
• Трактовка результатов молекулярно-генетических исследований.
• Словарь молекулярно-генетических терминов.

Подготовка к исследованию: специальной подготовки к исследованию не требуется.

Оценка генетических факторов предрасположенности к остеопорозу.

Варианты заключений:

G/G - полиморфизм, предрасполагающий к остеопорозу, не обнаружен;
G/Т - обнаружен полиморфизм, предрасполагающий к остеопорозу, в гетерозиготной форме;
Т/Т - обнаружен полиморфизм, предрасполагающий к остеопорозу, в гомозиготной форме.

Частота встречаемости вариантов полиморфизма в популяции: Т/Т 5 - 8%; G/Т 45 - 50%.

Преобладающий генотип: G/G.