Микробиота кишечника играет важную роль в поддержании здоровья и работоспособности человека. Считается, что она оказывает влияние на иммунную систему, метаболизм, психическое состояние и когнитивные функции человека.

Кишечная микробиота признана самостоятельным метаболически активным органом. Бактерии кишечника обеспечивают процессы ферментативного расщепления питательных веществ с образованием большого числа метаболитов, участвуют в синтезе витаминов, модулируют серотонинергическую нейротрансмиссию в центральной нервной системе, регулируют развитие и дифференцировку иммунокомпетентных клеток кишечника. Продукты бактериального переваривания стимулируют кишечную перистальтику и являются полноценным пластическим материалом, необходимым для поддержания гомеостаза в организме человека.

Нормофлора кишечника – это качественное и количественное соотношение разнообразных популяций микробов, поддерживающих биохимическое, метаболическое и иммунное равновесие, необходимое для сохранения здоровья.

По современным представлениям, абсолютное большинство (89%) в составе микробиоты здорового человека занимают микроорганизмы, относящиеся к двум крупным сообществам – бактероидам (Bacteroidetes) и фирмикутам (Firmicutes), каждое из которых состоит из множества родов. Бактероиды – группа анаэробных грамотрицательных бактерий трех классов (Bacteroidetes, Flavobacteria и Sphingobacteria).

Фирмикуты – преимущественно грамположительные бактерии двух основных классов – бацилл и клостридий (самые распространенные). К фирмикутам относятся стрептококки, стафилококки, лактобациллы, энтерококки и менее известные, но более многочисленные вейлонеллы, руминококки, эубактерии, пептострептококки.

Установлено, что общее количество всех бифидобактерий, которые входят в семейство актиномицетов, обычно не превышает 5% от общего количества бактерий толстой кишки, а лактобацилл – не более 1%.

При нарушении баланса в составе микрофлоры развивается дисбиоз, выраженный качественными и количественными изменениями микробиоты. Показано, что с дисбиозом кишечника связаны метаболические и иммунологические нарушения, патологии пищеварительной, нервной и сердечно-сосудистой систем, ожирение, диабет 2-го типа и другие заболевания. Измененный микробиом кишечника вовлечен в патогенез неинфекционных заболеваний органов пищеварения: воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК), синдрома раздраженного кишечника, колоректального рака, целиакии, печеночной энцефалопатии, неалкогольной жироваяой болезни печени, алкогольных поражений печени, желчнокаменной болезни и др.

Оценку состояния микробиоценоза толстого кишечника можно использовать как дополнительный тест при обследовании пациентов с метаболическими нарушениями, в частности, с ожирением. В пилотном исследовании, проведенном с использованием тест-системы «Колонофлор», были отмечены изменения микробиоты толстой кишки у людей с разными фенотипами ожирения. Отмечено снижение количества Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., B. thetaiotaomicron и повышение показателей общей бактериальной массы, Enterobacter spp./Citrobacter spp., обнаружены Klebsiella spp. и Proteus spp. в количествах, превышающих формально-нормативные, а также в фекалиях были обнаружены C. difficile, значимое снижение F. prausnitzii и увеличение частоты обнаружения E. coli и Klebsiella spp. Исследование «Колонофлор» использовалась при обследовании пациентов с желчнокаменной болезнью, у которых исследовали пробы желчи и участка стенки желчного пузыря, полученные путем лапороскопии. Микробиоценоз исследовали культуральным методом и методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. В таксономической структуре выявленных из желчного пузыря бактерий преобладали Bifidobacterium spp., Bacteroides spp., Lactobacillus spp., E. coli. Большинство выделенных бактерий Enterococcus spp. обладали генами, кодирующими различные факторы патогенности.

Исследование «Колонофлор» может найти применение в исследованиях, направленных на комплексную оценку прогрессирования толстокишечного дисбиоза, особенно у больных колоректальным раком. Изучение состояния микрофлоры толстой кишки методом ПЦР позволит выявлять пациентов с высоким риском прогрессирования дисбиоза, которым необходима предоперационная коррекция, что снизит частоту послеоперационных нежелательных явлений (диарея, колит и т. д.) и улучшит послеоперационное течение и качество жизни пациента.

«Колонофлор» можно использовать при обследовании пациентов, которым проведена аллогенная трансплантация гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК). К распространенным осложнениям алло-ТГСК, которые приводят к снижению эффективности лечения, относят инфекционное поражение желудочно-кишечного тракта вирусной этиологии и/или ассоциированное с Clostridium difficile на фоне иммунодефицита; антибиотикассоциированную диарею; реакцию трансплантат против хозяина (РТПХ). Поэтому для восстановления функциональной активности микробиоты и преодоления антибиотикорезистентности в ряде случаев проводят трансплантацию фекальной микробиоты (ТФМ) от здорового донора, что может приводить к эрадикации патогенных микроорганизмов, модуляции иммунной системы реципиента и как следствие к снижению активности РТПХ кишечника.